ncbi,如何利用bankit向ncbi在线批量提交序列?
许多期刊在文章发表之前需要在文章中有序列的登录号,并且要求你在文章发表时,序列可以被读者索取。 NCBI的GenBank提供了两个投递方式:
1、在线投递-BankIt,特点是比较方便。
2、本地投递文件生成程序——Sequin。目前NCBI seqin有MAC, PC和UNIX不同版本。其输出文件需要你通过电子邮件发给NCBI. 另外,上面所述一般适用于研究单个或多个功能基因的情况。如果大规模的测序如EST、 STS和GSS序列分别有专门的投递途径。 另外,提醒你的两个问题: 1、对你所投序列所属物种分类(拉丁名)要有所了解,这通常是出错的地方(seqin) 2、在你投递序列到发表文章之间,要注意NCBI发给你的电子邮件,它会询问你在什么时间将序列公布。
ncbi上下载基因数据怎么取消空行?
选择一个空行,然后点击删除键直接删除
怎么知道基因有多少外显子和内含子?
在NCBI上的OMIM数据库输入基因名,在TITLE上就会显示它的学名。
用学名检索基因是比较靠谱的。建议用ENSEMBL找基因,显示其外显子和内含子。进入ENSEMBL的方法有两种,1.NCBI上进入基因的检索条以后,summary里会有相应的ENSEMBL的链接(see related);
2.直接进入ENSEMBL主页检索该基因。进入基因的检索条以后,点左侧的CDNA和EXONS就能相应地看到转录本的注释信息,包括外显子和内含子的注释,5‘和3’UTR的注释,和密码子的注释。
ncbi使用教程?
ncbi的使用教程如下:
1、首先进入NCBI主页。
Map view演示,主要是找到相关基因在染色体上的位置,以人类IL-6基因为例。点击Map View
2、选择物种,点击Go;设置filter,过滤信息;点击Genes seq查询序列
3、最后进入序列下载页面,可以直接下载。可以选择多种格式,一般选择fasta。
4、通过clone查询相关基因的cDNA序列,选择clone数据库,search基因描述。
5、对基因的蛋白质序列和mRNA查询。
6、也可对序列进行查询。基因组展示。
7、也可以查询序列信息。
8、查询已知引物,通过probe数据库搜索。
9、同源性比对blast。有多种比对方式。DNA,RNA,Protein等比对模式,排列越高表示同源性越强。也可以进行引物比对。
知识拓展
NCBI是National Center for Biotechnology Information的缩写,指美国国家生物技术信息中心,建立于1988年。
NCBI的初衷是为了给分子生物学家提供一个信息储存和处理的系统。除了建有GenBank核酸序列数据库(该数据库的数据资源来自全球几大DNA数据库,其中包括日本DNA数据库DDBJ、欧洲分子生物学实验室数据库EMBL以及其它几个知名科研机构)之外,NCBI还可以提供众多功能强大的数据检索与分析工具。
ncbi网站怎么下载?
在小米应用商店下载安装。